MikroRNA (miRNA)

[Petr75]

(stroj)

30. ledna 2022
Katedra molekulární biologie a genetiky, Yildiz Technical University, Istanbul, Turecko
Identifikace miRNA a jejich potenciální účinky na dráhy související s roztroušenou sklerózou pomocí analýzy in silico
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35121245/

Abstraktní

Pozadí: MikroRNA (miRNA) regulují genovou expresi post-transkripčně prostřednictvím degradace mRNA. V důsledku toho mají dopad na různé dráhy v organismech, které jsou důležité jak pro zdraví, tak pro nemoc. miRNA mohou být použity jako potenciální diagnostické, prognostické a terapeutické biomarkery pro onemocnění související s imunitním a nervovým systémem, jako je MS.

Metoda: Diferenciálně exprimované miRNA ze vzorků periferní krve pacientů a kontrolních skupin byly vybrány z NCBI GEO Datasets pomocí GEO2R. Běžné miRNA a jejich příbuzné dráhy byly analyzovány pomocí miRNet, miRWalk, DIANA mirpath, KEGG dráhy. Cílové geny a jejich interakce protein-protein byly také hodnoceny pomocí STRING a GeneMANIA.

Výsledky: Našli jsme 12 běžných miRNA, z nichž čtyři byly považovány za důležitější v drahách souvisejících s RS, jako jsou imunitní a neurální signální sítě. Patří mezi ně dráhy neurotrofin, JAK-STAT, B buněčný receptor, ErbB, MAPK, Fc gama R-zprostředkovaná fagocytóza, chemokiny a signální dráhy receptoru T buněk. Dále byly provedeny analýzy cílových genů a byly nalezeny geny MAPK1, PIK3CD, PIK3R1, PIK3R2, PIK3R3, PIK3R5, AKT2, SOS2, RAF1. Další analýza ukázala, že identifikované geny a příbuzné dráhy mají interakce ve více bodech a že se překrývající s body které se běžně nacházejí v signální dráze PI3K-Akt.

Závěr: V tomto článku byly hodnoceny miRNA související s MS a jejich potenciální účinky na související dráhy. Tato studie může být použita k pochopení patogeneze RS a poskytuje nové nástroje pro objevování nových terapií.