Podrobná analýza microRNA profilů u eresky
Napsal: 03 bře 2014 13:54Podrobná analýza microRNA profilů u roztroušené sklerózy zahrnující sekvencování nové generace.
MicroRNAs (miRNAs) jsou krátké nekódující RNA s fukcí genové regulace jejichž profily exprese mohou sloužit jako biomerkery nemoci.
Cíl: Exprese miRNA byla analyzována u všech krevních vzorků neléčených pacientů s CIS (n=25), RRRS(n=25) a u 50ti zdravých lidí pomocí NGS (sekvencování nové generace), microarray analýzami a qRT-PCR.
Výsledky: U pacientů si CIS/RRRS, NGS a mikroarray analýzy identifikovaly 38 a resp. 8 významně deregulovaných miRNA. Bylo zjištěno, že tři z těchto miRNA byly výnamně zvýšené (hsa-miR-16-2-3p) nebo snížené (hsa-miR-20a-5p, hsa-miR-7-1-3p) dle obou metod. Jiných 5 z těchto miRNA jejichž regulace byla významně snížena na NGS obrazovce tak vykazovalo stejný směr v regulaci dle mikroarray analýz. qRT-PCR potvrdila směr regulace u všech osmi a výzmaně u tří miRNA.
Závěry: V této studii byla identifikována množina deregulovaných miRNA u CIS/RRRMS a studie znovu potvrdila již dříve hlášenou nízkou expresi hsa-miR-20a-5p u roztroušené sklerózy. hsa-miR-20a-5p a jiné ověřené miRNA mohou představovat slibné kandidáty pro budoucí vyhodnocování jako biomarkery roztroušené sklerózy a mohou mít relevanci v patofyziologii této nemoci.
http://msj.sagepub.com/content/20/3/295.abstract
MicroRNAs (miRNAs) jsou krátké nekódující RNA s fukcí genové regulace jejichž profily exprese mohou sloužit jako biomerkery nemoci.
Cíl: Exprese miRNA byla analyzována u všech krevních vzorků neléčených pacientů s CIS (n=25), RRRS(n=25) a u 50ti zdravých lidí pomocí NGS (sekvencování nové generace), microarray analýzami a qRT-PCR.
Výsledky: U pacientů si CIS/RRRS, NGS a mikroarray analýzy identifikovaly 38 a resp. 8 významně deregulovaných miRNA. Bylo zjištěno, že tři z těchto miRNA byly výnamně zvýšené (hsa-miR-16-2-3p) nebo snížené (hsa-miR-20a-5p, hsa-miR-7-1-3p) dle obou metod. Jiných 5 z těchto miRNA jejichž regulace byla významně snížena na NGS obrazovce tak vykazovalo stejný směr v regulaci dle mikroarray analýz. qRT-PCR potvrdila směr regulace u všech osmi a výzmaně u tří miRNA.
Závěry: V této studii byla identifikována množina deregulovaných miRNA u CIS/RRRMS a studie znovu potvrdila již dříve hlášenou nízkou expresi hsa-miR-20a-5p u roztroušené sklerózy. hsa-miR-20a-5p a jiné ověřené miRNA mohou představovat slibné kandidáty pro budoucí vyhodnocování jako biomarkery roztroušené sklerózy a mohou mít relevanci v patofyziologii této nemoci.
http://msj.sagepub.com/content/20/3/295.abstract