Komplexní analýzy microRNA profilů u roztroušené sklerózy
Napsal: 15 črc 2013 09:17MicroRNAs (miRNAs) jsou krátké, nekódující RNAs s genovými regulačními funkcemi jejichž exprimované profily mohou složit jako biomarkery nemoci.
Cílem této studie bylo provést komplexní analýzy miRNA exprimujících profilů v krvi pacientů s klinicky izolovaným syndromem (CIS) nebo s relaps remitující roztroušenou sklerózou (RR-RS) zahrnující sekvencování nové generace (NGS).
Metody: exprese miRNA byla analyzována v úplných krevních vzorcích od neléčených pacientů s CIS (n = 25) nebo RR-RS (n = 25) a 50ti zdravých lidí pomocí NGS, mikroarray analýz a quantitative real-time polymerase chain reaction (qRT-PCR).
Výsledky: U pacientů s CIS/RR-RS identifikovalo NGS a microarray analýzy 38 resp. 8 výrazně deregulovaných miRNA. Bylo oběma metodami objeveno, že tři z těchto miRNA se exprimují významně více (hsa-miR-16-2-3p) nebo méně (hsa-miR-20a-5p, hsa-miR-7-1-3p). Jiných 5 miRNA, kterých bylo exprimováno významně méně na zobrazení NGS vykázalo stejný směr regulace (že jich bylo méně/více) na microarray analýzách. qRT-PCR potvrdilo směr regulace(měně nebo více) pro všech osm a byl významný pro tři miRNA.
Závěr: Tato stude identifikuje množinu deregulovaných miRNAs u CIS/RR-RS a znovu potvrzuje již dříve ohlášenou nižší expresi hsa-miR-20a-5p u roztroušené sklerózy. hsa-miR-20a-5p a jiné ověřené miRNA mohou představovat slibné kandidáty pro budoucí vyhodnocování jako biomarkery roztroušené sklerózy a mohly by mít nějaký vztah k patofyziologii této nemoci.
http://msj.sagepub.com/content/early/20 ... 3.abstract
Cílem této studie bylo provést komplexní analýzy miRNA exprimujících profilů v krvi pacientů s klinicky izolovaným syndromem (CIS) nebo s relaps remitující roztroušenou sklerózou (RR-RS) zahrnující sekvencování nové generace (NGS).
Metody: exprese miRNA byla analyzována v úplných krevních vzorcích od neléčených pacientů s CIS (n = 25) nebo RR-RS (n = 25) a 50ti zdravých lidí pomocí NGS, mikroarray analýz a quantitative real-time polymerase chain reaction (qRT-PCR).
Výsledky: U pacientů s CIS/RR-RS identifikovalo NGS a microarray analýzy 38 resp. 8 výrazně deregulovaných miRNA. Bylo oběma metodami objeveno, že tři z těchto miRNA se exprimují významně více (hsa-miR-16-2-3p) nebo méně (hsa-miR-20a-5p, hsa-miR-7-1-3p). Jiných 5 miRNA, kterých bylo exprimováno významně méně na zobrazení NGS vykázalo stejný směr regulace (že jich bylo méně/více) na microarray analýzách. qRT-PCR potvrdilo směr regulace(měně nebo více) pro všech osm a byl významný pro tři miRNA.
Závěr: Tato stude identifikuje množinu deregulovaných miRNAs u CIS/RR-RS a znovu potvrzuje již dříve ohlášenou nižší expresi hsa-miR-20a-5p u roztroušené sklerózy. hsa-miR-20a-5p a jiné ověřené miRNA mohou představovat slibné kandidáty pro budoucí vyhodnocování jako biomarkery roztroušené sklerózy a mohly by mít nějaký vztah k patofyziologii této nemoci.
http://msj.sagepub.com/content/early/20 ... 3.abstract