B lymfocyty hrají zásadní roli v patologii roztroušené sklerózy pravděpodobně závislými a nezávislými způsoby na protilátkách. Intrathekální produkce imunoglobulinu G u roztroušené sklerózy je produkována klonálně rozšířenou populací B-buněk. Nedávné studie indikují že CDR imunoglobulínů specifické pro určité antigeny jsou často sdíleny mezi různými jedinci. V této studii bylo naším cílem identifikovat konkrétní proteomické profily mutovaných CDR imunoglobulinu G které jsou přítomné u RS pacientů, ale chybějící u zdravých lidí.
Aby se dosáhlo tohoto cíle, tak jsme z mozkomíšního moku u 29ti pacientů a 30 zdravých lidí vyčistili imunoglobin G a oddělili příslušné těžké a lehké řetězce pomocí SDS - PAGE. Následně byly vyříznuty/vyhlazeny (překlad?) proužky, tripsinizovány a změřeny s hmotnostní spektrometrií s vysokým rozlišením.
Sekvencovali jsme 841 těžkých a 771 lehkých řetězců peptidů z variabilní oblasti. Pozorovali jsme 24 těžkých a 26 lehkých CDR které byly přítomné téměř výhradně u pacientů s roztroušenou sklerózou. Za použití přísných kritérií pro identifikaci společných peptidů jsme objevili pět CDR sdílených u tří a více pacientů a nenašli u zdravých lidí. Zajimavé je, že jeden CDR s jednou mutací byl společný u šeti pacientů. A dále bylo pozorované, že jeden pacient nese podobné CDR s jinou mutací. A dále jsme objevili nějakou nesouměrnost v kapa až lambda poměru a v použití určitých měnitelných regionů které již dříve byly pozorovány na transkriptomní úrovni.
Na bílkovinové úrovni imunoglobulin G z mozkomíšního moku sdílí společné charakteristiky v antigen vázací oblasti mezi různými RS pacienty. Toto označení sdílených "otisků" může indikovat společný antigen (=naznačovat existenci společného antigenu) pro aktivaci B buněk.
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/2397 ... t=Abstract
Pojmy:
CRD - Complementarity determining regions - doplňkovost určující oblasti - jsou oblasti v protilátkách (v imunoglobulinech) nebo v T-buněčných receptorech kde tyto bílkoviny doplňují nějaký tvar antigenu. Příklad CDR v konkrétní bílkovině:
